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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine. 

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

222

NOMBRE DE NOTICES

72

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Actinorhizal symbiosis DDDH Virulence Evolution Gut microbiota Iron uptake ESBL Metabolomics Continuous culture Dichloromethane Nitrification Natural products Genome sequence Horizontal gene transfer ACL Lactobacillus Genome evolution Cyanobacteria Bactérie Activated sludge Molecular evolution Escherichia coli Holobiont Mineral weathering Microbial genomics Betaproteobacteria Clostridioides difficile Bacteroidetes Polyphasic taxonomy Magnetotaxis Genomics Dehalogenation Bacterial genetics Mobile genetic elements Magnetotactic bacteria Alkaline thermal spring Arsenic Lactic acid bacteria Thermophile Complete genome Bacteria Functional genomics Agrobacterium tumefaciens Microbiology Transcriptomics Fish pathogen Marine bacteria Coevolution Brochothrix thermosphacta Archaea Genomes Bacterial Acinetobacter baumannii Anaerobic Acid mine drainage AMD Digital DNA-DNA hybridization Nitrogen fixing Bacteriophage Genome Insect Legume-rhizobium symbiosis Metabolic networks Proteomics Genome mining Fish pathogens Formate assimilation Directed evolution Bacteriocin Average nucleotide identity Adaptation Bioremediation Gene regulation Oxidative stress Pangenome Metabolism Virulence factors Secondary metabolites Nitrogen fixation Rhizobium CTX-M-15 Genome-scale metabolic networks Heavy metal resistance Aquaculture Fish-pathogenic bacteria Hydrothermal Fitness cost Experimental evolution Flavobacteriaceae Flavobacterium psychrophilum Food Transcriptome Pathogenicity Biofilm HGT Phylogeny Comparative genomics Biodiversity Symbiosis Metagenomics Functional annotation