Journal articles
Whole-Genome Sequence of Mycobacterium ulcerans CSURP7741, a French Guianan Clinical Isolate
Jamal Saad
1, 2
Marine Combe
3
Nassim Hammoudi
1
Pierre Couppié
4
Romain Blaizot
5
Farah Jedir
5
Rodolphe Elie Gozlan
6
Michel Drancourt
1, 2
Amar Bouam
1
Jamal Saad 1, 2
Author
Marine Combe 3
Author IdHAL : marine-combe
Nassim Hammoudi 1
Author
Pierre Couppié 4
Author
Romain Blaizot 5
Author
Farah Jedir 5
Author
Rodolphe Elie Gozlan 6
Author
Michel Drancourt 1, 2
Author Employer institution : Aix Marseille Université IdHAL : michel-drancourt IdRef : https://www.idref.fr/060258411
Amar Bouam 1
Author
1
MEPHI - Microbes évolution phylogénie et infections (IHU Méditerranée Infection
19-21 Bd Jean Moulin
13005 Marseille - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR FRE2013 (France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement : UMR FRE2013 (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR FRE2013 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
2
IHU Marseille - Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU - Méditerranée Infection
19-21 Bd Jean Moulin
13005 MARSEILLE
FRANCE - France)
3
UMR ISEM - Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (Place E. Bataillon CC 064 34095 Montpellier Cedex 05 - France)
- Cirad - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR116 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France)
- EPHE - École pratique des hautes études (4-14 Rue Ferrus, 75014 Paris - France)
- PSL - Université Paris sciences et lettres (60 rue Mazarine 75006 Paris - France)
- UM - Université de Montpellier (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France)
- Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226 (France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5554 (France)
4
EPat - Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (Campus de Troubiran - BP 20792 - 97337 CAYENNE CEDEX - French Guiana)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- UG - Université de Guyane : EA3593 (Campus de Troubiran - BP 20792- 97337 Cayenne Cedex - Guyane - French Guiana)
5
Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française] (Av des flamboyants, Cayenne 97306 - French Guiana)
6
BOREA - Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques (Muséum national d'Histoire naturelle - 7, rue Cuvier - CP 32 - 75231 Paris Cedex 05 - France)
- UNICAEN - Université de Caen Normandie (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 CAEN Cedex 5 - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle (57, rue Cuvier - 75231 Paris Cedex 05 - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- SU - Sorbonne Université : UM95 (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8067 / UMR7208 (France)
- UA - Université des Antilles (Université des Antilles | Fouillole - BP 250 - 97157 Pointe-à-Pitre - France)
Abstract : Combined Nanopore and Illumina whole-genome sequencing of a French Guianan Mycobacterium ulcerans (Buruli ulcer agent) clinical isolate yielded a 5.12-Mbp genome with a 65.5% GC content, 5,215 protein-coding genes, and 51 predicted RNA genes. This publicly available M. ulcerans whole-genome sequence from a strain isolated in South America is closely related to M. ulcerans subsp. liflandii.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadata
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-02481996
Contributor : Isabelle Combe <>
Submitted on : Tuesday, February 23, 2021 - 11:23:49 AM
Last modification on : Tuesday, May 4, 2021 - 7:54:05 PM
Contributor : Isabelle Combe <>
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Licence
Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
Identifiers
- HAL Id : hal-02481996, version 1
- DOI : 10.1128/MRA.00215-19
- IRD : fdi:010076256
Collections
UNIV-AMU | PSL | B3ESTE | UNIV-MONTPELLIER | GUYANE | UNICAEN | SORBONNE-UNIVERSITE | SU-SCIENCES | SU-TI | AGROPOLIS | CIRAD | MNHN | EPHE | UNIV-AG | CNRS | ISEM | BOREA | COMUE-NORMANDIE | IRD
Citation
Jamal Saad, Marine Combe, Nassim Hammoudi, Pierre Couppié, Romain Blaizot, et al.. Whole-Genome Sequence of Mycobacterium ulcerans CSURP7741, a French Guianan Clinical Isolate. Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (29), ⟨10.1128/MRA.00215-19⟩. ⟨hal-02481996⟩
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