Staphylococcus capitis isolated from bloodstream infections: a nationwide 3-month survey in 38 neonatal intensive care units

Marie Decalonne (1) , Sandra dos Santos (2) , Rémi Gimenes (1) , Florent Goube (1) , Géraldine Abadie (3) , Emilie Benabid (4) , Said Aberrane (5) , Vanina Ambrogi , Raoul Baron (6) , Patrick Barthelemy (7) , Isabelle Bauvin (8) , Olivier Belmonte (9) , Rafik Ben Ammar (10) , Salma Ben Hadj Yahia (11) , Yasmina Berrouane (12) , Philippe Berthelot (13) , Alain Beuchée (14) , Emmanuelle Bille (15) , Pascal Bolot (16) , Stéphanie Bordes-Couecou (17) , Antoine Bouissou (2) , Sandra Bourdon (18) , Nadège Bourgeois-Nicolaos (10) , Sophie Boyer (19) , Christian Cattoen (20) , Vincent Cattoir (21) , Chantal Chaplain (9) , Céline Chatelet (22) , Aurore Claudinon (23) , Nathalie Chautemps (24) , Hélène Cormier (25) , Céline Coroller-Bec (26) , Benjamin Cotté (27) , Carole de Chillaz (28) , Olivier Dauwalder (29) , Aude Davy (30) , Martine Delorme (31) , Maryvonne Demasure (32) , Luc Desfrere (33) , Michel Drancourt (34) , Clarisse Dupin (35, 30) , Véronique Faraut-Derouin (10) , Arnaud Florentin (36) , Virginie Forget (37) , Nicolas Fortineau (38) , Tania Foucan (39) , Pierre Frange (28) , Karine Gambarotto (9) , Géraldine Gascoin (25) , Laure Gibert (40) , Jacques Gilquin (41) , Audrey Glanard (42) , Jacqueline Grando (29) , Alain Gravet (43) , Jérôme Guinard (25) , Geneviève Héry-Arnaud (44) , Claire Huart (20) , Nadia Idri (33) , Jean-Marc Jellimann (45) , Olivier Join-Lambert (46) , Sylvie Joron (47) , Philippe Jouvencel (17) , Marie Kempf (48) , Sophie Ketterer-Martinon (49) , Mouna Khecharem (38) , Serge Klosowski (22) , Franck Labbe (50) , Adeline Lacazette (39) , Fabrice Lapeyre (20) , Jérôme Larche (51) , Peggy Larroude (8) , Anne Le Pourhiennec (47) , Nolwenn Le Saché (38) , Sylvie Ledru (22) , Annick Lefebvre (52) , Clément Legeay (25) , Florence Lemann (23) , Claire Lesteven (53) , Marion Levast-Raffin (24) , David Leyssene (54) , Isabelle Ligi (55) , Alain Lozniewski (56) , Pierre Lureau (31) , Franck-Olivier Mallaval (24) , Edith Malpote (39) , Stéphane Marret (57) , Pascale Martres (4) , Guillaume Menard (14) , Laura Menvielle (58) , Laurent Mereghetti (59, 60) , Veronique Merle (61) , Pascale Minery (43) , Virginie Morange (62) , Julien Mourdie (50) , Anaëlle Muggeo (63) , Jean Nakhleh (43) , Marie-Noëlle Noulard (64) , Claude Olive (49) , Hugues Patural (65) , Pascale Penn (26) , Manuel Petitfrere (66) , Bruno Pozetto (67) , Brigitte Riviere (68) , Audrey Robine (26) , Christine Roques Ceschin (69) , Raymond Ruimy (12) , Amine Siali (5) , Stéphanie Soive (30) , Souad Slimani (70) , Anne-Sophie Trentesaux (53) , Dominique Trivier (71) , Christian Vandenbussche (64) , Laurent Villeneuve (8) , Evelyne Werner (32) , Stéphane Le Vu (72) , Nathalie van Der Mee-Marquet (73, 74, 60)

1 Hôpital Bretonneau
2 CHU Trousseau [Tours]
3 Centre hospitalier Félix-Guyon [Saint-Denis, La Réunion]
4 Centre Hospitalier René Dubos [Pontoise]
5 CHIC - Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil
6 CHRU Brest - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest
7 LA CONCEPTION - Hôpital de la Conception [CHU - APHM]
8 Centre hospitalier de Pau
9 CHU La Réunion - Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion
10 AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart]
11 Centre Hospitalier de Calais
12 CHU Nice - Centre Hospitalier Universitaire de Nice
13 CHU de Saint-Etienne - Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne
14 CHU Pontchaillou [Rennes]
15 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
16 Centre Hospitalier de Saint-Denis [Ile-de-France]
17 Le CHCB, Centre Hospitalier de la Côte Basque
18 Groupe Hospitalier du Havre
19 Hôpital Charles Nicolle [Rouen]
20 Centre hospitalier [Valenciennes, Nord]
21 Centre Hospitalier Universitaire [Rennes]
22 GHT de l'Artois
23 Centre Hospitalier Victor Dupouy
24 Centre Hospitalier Métropole Savoie [Chambéry]
25 CHU Angers - Centre Hospitalier Universitaire d'Angers
26 Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans)
27 Clinique du Val d'Ouest
28 CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]
29 HCL - Hospices Civils de Lyon
30 Centre hospitalier Saint-Brieuc
31 CH Georges Renon Niort - Centre Hospitalier Georges Renon [Niort]
32 CHRO - Centre Hospitalier Régional d'Orléans
33 Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes]
34 MEPHI - Microbes évolution phylogénie et infections
35 CHU de Saint-Brieuc
36 INGRES - Interactions Gènes-Risques environnementaux et Effets sur la Santé
37 EPHOR - Unité de Recherche Environnement Physique de la plante Horticole
38 AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre)
39 CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe]
40 GRAM 2.0 - Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne
41 Hôpital Hôtel-Dieu [Paris]
42 Hôpital Delafontaine
43 Centre Hospitalier de Mulhouse, site du Hasenrain (Mulhouse)
44 LUBEM - Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne
45 Service de réanimation néonatale [CHRU Nancy]
46 UMR_S 570 - Pathogénie des infections systémiques
47 CRPV - Centre Régional de PharmacoVigilance Nord-Pas-de-Calais [CHU Lille]
48 CRCNA - Centre de Recherche en Cancérologie Nantes-Angers
49 CHU de la Martinique [Fort de France]
50 GHH - Groupe Hospitalier du Havre Hôpital Jacques Monod (MONTIVILLIERS)
51 Polyclinique Médipôle Saint-Roch [Cabestany]
52 CHU Reims - Centre Hospitalier Universitaire de Reims
53 CHU Caen
54 UdA - Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I
55 AMU SMPM MED - Aix-Marseille Université - École de médecine
56 Service de microbiologie [CHU Nancy]
57 NU - Normandie Université
58 Service psychiatrique de l'enfant et de l'adolescent [CHU Hôpital Robert Debré]
59 Service de bactériologie-virologie [Tours]
60 UMR ISP - Infectiologie et Santé Publique
61 Registre EPIMAD
62 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
63 StaPath - Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis
64 Groupe Hospitalier Artois-Ternois Centre Hospitalier d’Arras
65 SNA - EPIS - Système Nerveux Autonome - Epidémiologie, Physiologie, Ingénierie, Santé
66 ELSAN Polyclinique Majorelle
67 CHU Saint-Etienne
68 CHIC-CM - Centre Hospitalier Intercommunal Castres-Mazamet
69 CHU Toulouse - Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse
70 Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique]
71 Centre Hospitalier de Lens
72 INVS - Institut de Veille Sanitaire
73 Hôpital Bretonneau
74 Hôpital Trousseau

To increase the knowledge about S. capitis in the neonatal setting, we conducted a nationwide 3-month survey in 38 neonatal intensive care units (NICUs) covering 56.6% of French NICU beds. We demonstrated 14.2% of S. capitis BSI (S.capBSI) among nosocomial BSIs. S.capBSI incidence rate was 0.59 per 1000 patient-days. A total of 55.0% of the S.capBSIs were late onset catheter-related BSIs. The S. capitis strains infected preterm babies (median gestational age 26 weeks, median birth weight 855 g). They were resistant to methicillin and aminoglycosides and belonged to the NRCS-A clone. Evolution was favorable in all but one case, following vancomycin treatment.

Keywords: Neonates; Preterm babies; Neonatal Intensive Care Unit (NICU); Nationwide active surveillance; NRCS-A clone; Bloodstream catheter-related infection; Staphylococcus capitis

Domains: Life Sciences [q-bio]; Microbiology and Parasitology; Bacteriology; Life Sciences [q-bio]; Microbiology and Parasitology; Virology; Life Sciences [q-bio]; Microbiology and Parasitology; Parasitology; Life Sciences [q-bio]; Human health and pathology; Cardiology and cardiovascular system; Life Sciences [q-bio]; Human health and pathology; Emerging diseases; Life Sciences [q-bio]; Human health and pathology; Infectious diseases

Marie Decalonne, Sandra dos Santos, Rémi Gimenes, Florent Goube, Géraldine Abadie, et al.. Staphylococcus capitis isolated from bloodstream infections: a nationwide 3-month survey in 38 neonatal intensive care units. European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2020, 39 (11), pp.2185-94. ⟨10.1007/s10096-020-03925-5⟩. ⟨hal-02868692⟩