Enteric pathogenic bacteria and resistance gene carriage in the homeless population in Marseille, France
Tran Duc Anh Ly
(1)
,
Linda Hadjadj
(2)
,
van Thuan Hoang
(1, 3)
,
Ndiaw Goumbala
(1)
,
Thi Loi Dao
(1, 3)
,
Sekene Badiaga
(2)
,
Herve Tissot-Dupont
(2)
,
Philippe Brouqui
(2)
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Didier Raoult
(2)
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Jean-Marc Rolain
(2)
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Philippe Gautret
(1)
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Henriette Bosson-Vanga
,
Nicolas Primas
,
Jean-François Franetich
,
Catherine Lavazec
,
Lina Gomez
,
Kutub Ashraf
,
Maurel Tefit
,
Valérie Soulard
,
Nathalie Dereuddre-Bosquet
,
Roger Le Grand
,
Mélanie Donnette
,
Romain Mustière
,
Nadia Amanzougaghene
,
Shahin Tajeri
,
Peggy Suzanne
,
Aurélie Malzert-Fréon
,
Sylvain Rault
,
Patrice Vanelle
,
Sébastien Hutter
,
Anita Cohen
,
Georges Snounou
,
Pierre Roques
,
Nadine Azas
,
Prisca Lagardère
,
Vincent Lisowski
,
Nicolas Masurier
,
Michel Nguyen
,
Lucie Paloque
,
Françoise Benoit-Vical
,
Pierre Verhaeghe
,
Dominique Mazier
van Thuan Hoang
- Fonction : Auteur
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Philippe Brouqui
- Fonction : Auteur
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Didier Raoult
- Fonction : Auteur
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Jean-Marc Rolain
- Fonction : Auteur
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Philippe Gautret
- Fonction : Auteur
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Henriette Bosson-Vanga
- Fonction : Auteur
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Nicolas Primas
- Fonction : Auteur
Jean-François Franetich
- Fonction : Auteur
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Catherine Lavazec
- Fonction : Auteur
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Lina Gomez
- Fonction : Auteur
Kutub Ashraf
- Fonction : Auteur
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Maurel Tefit
- Fonction : Auteur
Valérie Soulard
- Fonction : Auteur
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Nathalie Dereuddre-Bosquet
- Fonction : Auteur
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Roger Le Grand
- Fonction : Auteur
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Mélanie Donnette
- Fonction : Auteur
Romain Mustière
- Fonction : Auteur
Nadia Amanzougaghene
- Fonction : Auteur
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Shahin Tajeri
- Fonction : Auteur
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Peggy Suzanne
- Fonction : Auteur
Aurélie Malzert-Fréon
- Fonction : Auteur
Sylvain Rault
- Fonction : Auteur
Patrice Vanelle
- Fonction : Auteur
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Sébastien Hutter
- Fonction : Auteur
Anita Cohen
- Fonction : Auteur
Georges Snounou
- Fonction : Auteur
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Pierre Roques
- Fonction : Auteur
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Nadine Azas
- Fonction : Auteur
Prisca Lagardère
- Fonction : Auteur
Vincent Lisowski
- Fonction : Auteur
Nicolas Masurier
- Fonction : Auteur
Michel Nguyen
- Fonction : Auteur
Lucie Paloque
- Fonction : Auteur
Françoise Benoit-Vical
- Fonction : Auteur
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Pierre Verhaeghe
- Fonction : Auteur
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Dominique Mazier
- Fonction : Auteur
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Résumé
Abstract We aimed to assess the prevalence of pathogenic bacteria and resistance genes in rectal samples collected among homeless persons in Marseille, France. In February 2014 we enrolled 114 sheltered homeless adults who completed questionnaires and had rectal samples collected. Eight types of enteric bacteria and 15 antibiotic resistance genes (ARGs) were sought by real-time polymerase chain reaction (qPCR) performed directly on rectal samples. ARG-positive samples were further tested by conventional PCR and sequencing. We evidenced a 17.5% prevalence of gastrointestinal symptoms, a 9.6% prevalence of enteric pathogenic bacteria carriage, including Escherichia coli pathotypes (8.7%) and Tropheryma whipplei (0.9%). Only 2 persons carried bla CTX-M-15 resistance genes (1.8%), while other genes, including carbapenemase-encoding genes and colistin-resistance genes, ( mcr -1 to mcr - 6, mcr-8 ) were not detected. Our results suggest that sheltered homeless persons in Marseille do not have a high risk of harbouring gastrointestinal antibiotic resistant bacteria.