Draft Genome Sequence of the White-Rot Fungus Obba rivulosa 3A-2
S. Haridas
,
R. Albert
,
M. Binder
(1)
,
J. Bloem
,
Kurt Labutti
(2)
,
A. Salamov
(3)
,
B. Andreopoulos
,
S.E. Baker
,
Kerrie Barry
(4)
,
G. Bills
,
B.H. Bluhm
,
C. Cannon
,
R. Castanera
,
D.E. Culley
,
C. Daum
,
D. Ezra
,
J.B. González
,
Bernard Henrissat
(5)
,
A. Kuo
,
C. Liang
,
Anna Lipzen
,
F. Lutzoni
,
J. Magnuson
,
S.J. Mondo
,
M. Nolan
,
R.A. Ohm
,
J. Pangilinan
,
H.-J. Park
,
L. Ramírez
,
M. Alfaro
,
H. Sun
,
A. Tritt
,
Y. Yoshinaga
,
L.-H. Zwiers
,
B.G. Turgeon
,
S.B. Goodwin
,
J.W. Spatafora
,
P.W. Crous
,
I.V. Grigoriev
,
Thirumalaiselvi Ulaganathan
,
Rong Shi
,
Deqiang Yao
,
Ruo-Xu Gu
,
Marie-Line Garron
,
Maia Cherney
,
D Peter Tieleman
,
Eric Sterner
,
Guoyun Li
,
Lingyun Li
,
Robert Linhardt
,
Miroslaw Cygler
,
Niël van Wyk
,
Michel Drancourt
,
Laurent Kremer
,
Otto Miettinen
,
Robert Riley
,
Dan Cullen
,
Ronald de Vries
,
Matthieu Hainaut
(5)
,
Annele Hatakka
,
Kristiina Hildén
,
Rita Kuo
,
Miia Mäkelä
,
Laura Sandor
,
Joseph Spatafora
,
Igor Grigoriev
,
David Hibbett
S. Haridas
- Fonction : Auteur
R. Albert
- Fonction : Auteur
J. Bloem
- Fonction : Auteur
Kurt Labutti
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758166
- ORCID : 0000-0002-5838-1972
B. Andreopoulos
- Fonction : Auteur
S.E. Baker
- Fonction : Auteur
Kerrie Barry
- Fonction : Auteur
- PersonId : 776761
- ORCID : 0000-0002-8999-6785
G. Bills
- Fonction : Auteur
B.H. Bluhm
- Fonction : Auteur
C. Cannon
- Fonction : Auteur
R. Castanera
- Fonction : Auteur
D.E. Culley
- Fonction : Auteur
C. Daum
- Fonction : Auteur
D. Ezra
- Fonction : Auteur
J.B. González
- Fonction : Auteur
Bernard Henrissat
- Fonction : Auteur
- PersonId : 833340
A. Kuo
- Fonction : Auteur
C. Liang
- Fonction : Auteur
Anna Lipzen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 773817
- ORCID : 0000-0003-2293-9329
F. Lutzoni
- Fonction : Auteur
J. Magnuson
- Fonction : Auteur
S.J. Mondo
- Fonction : Auteur
M. Nolan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 758023
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R.A. Ohm
- Fonction : Auteur
J. Pangilinan
- Fonction : Auteur
H.-J. Park
- Fonction : Auteur
L. Ramírez
- Fonction : Auteur
M. Alfaro
- Fonction : Auteur
H. Sun
- Fonction : Auteur
A. Tritt
- Fonction : Auteur
Y. Yoshinaga
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L.-H. Zwiers
- Fonction : Auteur
B.G. Turgeon
- Fonction : Auteur
S.B. Goodwin
- Fonction : Auteur
J.W. Spatafora
- Fonction : Auteur
P.W. Crous
- Fonction : Auteur
- PersonId : 780919
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I.V. Grigoriev
- Fonction : Auteur
Thirumalaiselvi Ulaganathan
- Fonction : Auteur
Rong Shi
- Fonction : Auteur
Deqiang Yao
- Fonction : Auteur
Ruo-Xu Gu
- Fonction : Auteur
Marie-Line Garron
- Fonction : Auteur
Maia Cherney
- Fonction : Auteur
D Peter Tieleman
- Fonction : Auteur
Eric Sterner
- Fonction : Auteur
Guoyun Li
- Fonction : Auteur
Lingyun Li
- Fonction : Auteur
Robert Linhardt
- Fonction : Auteur
Miroslaw Cygler
- Fonction : Auteur
Niël van Wyk
- Fonction : Auteur
Michel Drancourt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 182550
- IdHAL : michel-drancourt
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Laurent Kremer
- Fonction : Auteur
Otto Miettinen
- Fonction : Auteur
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Robert Riley
- Fonction : Auteur
Dan Cullen
- Fonction : Auteur
Ronald de Vries
- Fonction : Auteur
Annele Hatakka
- Fonction : Auteur
Kristiina Hildén
- Fonction : Auteur
- PersonId : 776735
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Rita Kuo
- Fonction : Auteur
Miia Mäkelä
- Fonction : Auteur
Laura Sandor
- Fonction : Auteur
Joseph Spatafora
- Fonction : Auteur
Igor Grigoriev
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791663
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David Hibbett
- Fonction : Auteur
Résumé
ABSTRACT We report here the first genome sequence of the white-rot fungus Obba rivulosa (Polyporales, Basidiomycota), a polypore known for its lignin-decomposing ability. The genome is based on the homokaryon 3A-2 originating in Finland. The genome is typical in size and carbohydrate active enzyme (CAZy) content for wood-decomposing basidiomycetes.
Mots clés
New taxa
Rhizodiscinaceae Crous
active site
crystal structure
heparin lyase
protein dynamics
substrate specificity
CAZy database
Mycobacterium tuberculosis
Rpfs
glycoside hydrolase
trehalose
Aulographales Crous
Spatafora
Haridas & Grigoriev
Coniosporiaceae Crous
Coniosporiales Crous
Eremomycetales Crous
Fungal evolution
Genome-based prediction
Lineolataceae Crous
Lineolatales Crous
Machine-learning