Journal articles
Automatic recognition of flow cytometric phytoplankton functional groups using convolutional neural networks
Robin Fuchs 1 Melilotus Thyssen 2 Véronique Creach 3 Mathilde Dugenne 4 Lloyd Izard 5 Marie Latimier 6 Arnaud Louchart 7 Pierre Marrec 8 Machteld Rijkeboer Gérald Grégori 2 Denys Pommeret 9
5
PROTEO - Processus et interactions de fine échelle océanique
LOCEAN - Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques
Robin Fuchs 1
Author
ORCID : 0000-0002-9907-0003
Melilotus Thyssen 2
Author
IdHAL : melilotus-thyssenORCID : 0000-0001-9517-1782IdRef : 127365613
Véronique Creach 3
Author
ORCID : 0000-0002-4957-5169
Mathilde Dugenne 4
Author
ORCID : 0000-0002-9316-1473
Lloyd Izard 5
Author
ORCID : 0000-0002-7181-9203
Marie Latimier 6
Author
Arnaud Louchart 7
Author
ORCID : 0000-0003-1549-4261
Pierre Marrec 8
Author
IdHAL : pierre-marrecORCID : 0000-0002-7811-4150IdRef : 185531466
Machteld Rijkeboer
Author
ORCID : 0000-0003-1531-9076
Gérald Grégori 2
Author
IdHAL : gerald-gregoriORCID : 0000-0003-1645-9468IdRef : 15011530X
Denys Pommeret 9
Author
ORCID : 0000-0002-6128-1008
1
I2M - Institut de Mathématiques de Marseille (Centre de Mathématiques et Informatique (CMI)
Technopôle Château-Gombert
39, rue Frédéric Joliot Curie
13453 Marseille Cedex 13 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR7373 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- ECM - École Centrale de Marseille : UMR7373 (Pôle de l'étoile - Technopole de Château-Gombert - 38 rue Frédéric Joliot-Curie - 13013 Marseille - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7373 (France)
2
MIO - Institut méditerranéen d'océanologie (M.I.O. Institut Méditerranéen d'Océanologie
Bâtiment Méditerranée
163 Avenue de Luminy
13288 Marseille - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement : UMR_D235 (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UM110 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers : UMR7294 (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- UTLN - Université de Toulon : UMR7294 (Avenue de l'Université - BP 20132 - 83957 La Garde Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7294 (France)
3
CEFAS - Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science [Lowestoft] (Pakefield Road
Lowestoft
Suffolk NR33 0HT - United Kingdom)
4
University of Hawaii (United States)
5
PROTEO - Processus et interactions de fine échelle océanique (France)
- LOCEAN - Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (case 100 - 4 place Jussieu - 75252 PARIS CEDEX 05 ; Institut de Recherche pour le Développement - Centre de recherche d'Ile-de-France - 32 avenue Henri Varagnat - 93143 Bondy Cedex
- France)
- MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle : USM402 (57, rue Cuvier - 75231 Paris Cedex 05 - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- SU - Sorbonne Université : UM71 (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7159 (France)
- IPSL (FR_636) - Institut Pierre-Simon-Laplace (4 Place Jussieu 75252 PARIS CEDEX 05 - France)
- ENS-PSL - École normale supérieure - Paris (45, Rue d'Ulm - 75230 Paris cedex 05 - France)
- PSL - Université Paris sciences et lettres (60 rue Mazarine 75006 Paris - France)
- UVSQ - Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (55 avenue de Paris - 78035 Versailles cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- X - École polytechnique (École polytechnique, 91128 Palaiseau Cedex - France)
- CNES - Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (18 avenue Edouard Belin 31401 Toulouse - France)
- SU - Sorbonne Université (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : FR_636 (France)
- UPCité - Université Paris Cité : FR_636 (85 boulevard Saint-Germain 75006 Paris - France)
- ENS-PSL - École normale supérieure - Paris (45, Rue d'Ulm - 75230 Paris cedex 05 - France)
6
DYNECO - Dynamiques des Écosystèmes Côtiers (France)
7
SZN - Stazione Zoologica Anton Dohrn (Villa Comunale, 80121 Napoli - Italy)
8
Graduate School of Oceanography [Narragansett] (Narragansett, Rhode Island, USA - United States)
- URI - University of Rhode Island (45 Upper College Rd, Kingston, RI 02881, USA - United States)
9
SAF - Laboratoire de Sciences Actuarielle et Financière (50, avenue Tony Garnier 69007 Lyon - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 : EA2429 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
Document type :
Journal articles
Complete list of metadata
https://hal-amu.archives-ouvertes.fr/hal-03688058
Contributor : Gérald Grégori Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, June 3, 2022 - 4:26:30 PM
Last modification on : Friday, August 5, 2022 - 11:54:57 AM
Contributor : Gérald Grégori Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, June 3, 2022 - 4:26:30 PM
Last modification on : Friday, August 5, 2022 - 11:54:57 AM
Links full text
Identifiers
- HAL Id : hal-03688058, version 1
- DOI : 10.1002/lom3.10493
- WOS : 000804784300001
Collections
CEA | INSU | MNHN | X | ENS-PARIS | UNIV-TLN | CNRS | UNIV-AMU | UNIV-LYON1 | EC-MARSEILLE | MIO | OSU-INSTITUT-PYTHEAS | LOCEAN | I2M | I2M-2014- | UVSQ | LABO-SAF | PSL | UNIV-PARIS-SACLAY | SORBONNE-UNIVERSITE | SU-SCIENCES | FR-636 | IP_PARIS | UDL | UNIV-PARIS | UP-SCIENCES | MIO-CYBELE | SU-TI
Citation
Robin Fuchs, Melilotus Thyssen, Véronique Creach, Mathilde Dugenne, Lloyd Izard, et al.. Automatic recognition of flow cytometric phytoplankton functional groups using convolutional neural networks. Limnology and Oceanography: Methods, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2022, ⟨10.1002/lom3.10493⟩. ⟨hal-03688058⟩
Metrics
Record views